I - Preparo
Não é necessário preparo

II - Exame
- Não é necessário pedido médico.
- Resultados serão disponibilizados na plataforma Varsmetagen e arquivos processados serão disponibilizados para download (FASTQ e CSV) conforme solicitação.
- Não será liberado um laudo no sistema.

Não se aplica, pois não há coleta de amostra.
Dados brutos devem seguir diretrizes próprias de qualidade, sendo responsabilidade do cliente o envio de dados adequados para análise.

O exame inclui a análise de bioinformática utilizando um pipeline padronizado de microbioma 16S/ITS focado na identificação da diversidade e abundância de bactérias e fungos a partir de dados de sequenciamento massivo paralelo (NGS) de amplicon 16S/ITS de uma amostra. Os resultados principais são disponibilizados através de tabelas e gráficos na plataforma proprietária Varsmetagen, onde também é possível fazer o download dos arquivos processados:
FASTQ: Arquivo com as sequências curtas de sequenciamento pós controle de qualidade
FASTA: Arquivo com as sequências ASVs
CSV: Tabela com a identificação taxonômica dos organismos e métricas de abundância e diversidade
ASV Tables: Tabelas contendo variantes de sequência amplicon (ASVs) identificadas na análise.

O exame de microbioma 16S/ITS é uma análise avançada desenvolvida para identificar e quantificar a diversidade e abundância de micro-organismos presentes no corpo humano ou em amostras ambientais. Diferente de testes que focam em patógenos específicos, o exame de microbioma utiliza a tecnologia de sequenciamento massivo paralelo para caracterizar amplamente a comunidade microbiana, fornecendo insights detalhados sobre a composição e a saúde do microbioma do paciente.
O exame de microbioma baseia-se no sequenciamento das regiões 16S rRNA para bactérias e ITS para fungos, que são altamente conservadas e permitem a identificação taxonômica precisa dos micro-organismos presentes nas amostras. A análise é realizada em amostras clínicas como sangue, saliva, fezes, ou outros tecidos. Essa abordagem permite uma avaliação detalhada da microbiota, incluindo a identificação de disbioses ou desequilíbrios microbianos que podem estar associados a diversas condições de saúde.
Os dados de sequenciamento são analisados para gerar métricas de diversidade, como o índice de Shannon e o índice de Simpson, e métricas de abundância relativa dos diferentes micro-organismos. Esses resultados são interpretados por microbiologistas e bioinformatas certificados, que consideram o histórico médico do paciente para fornecer uma análise clínica relevante.

Os seguintes arquivos podem ser disponibilizados para análise adicional:
FASTQ: Arquivo com as sequências curtas de sequenciamento pós controle de qualidade
FASTA: Arquivo com as sequências ASVs
CSV: Tabela com a identificação taxonômica dos microrganismos e métricas de abundância e diversidade.
ASV Tables: Tabelas contendo variantes de sequência amplicon (ASVs) identificadas na análise.