Manual de exames

PAINEL GENÉTICO PARA EPILEPSIAS, Ataxias, Farma, Vários Materiais

Outros nomes: PAINEL NGS PARA EPILEPSIAS E ATAXIAS, PAINEL GENÉTICO DE MUTAÇÕES GERMINATIVAS PARA EPILEPSIAS E ATAXIAS, MUTAÇÕES PARA EPILEPSIAS E ATAXIAS, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO PARA PREDISPOSIÇÃO A EPILEPSIAS E ATAXIAS

Este exame não precisa ser agendado

Orientações necessárias

"I - Preparo

Amostra de sangue: Não é necessário preparo
Amostras de saliva ou swab: 30 minutos antes da coleta, não beber, comer, fumar, mascar chicletes, escovar os dentes ou inserir qualquer objeto na boca.

II - Exame

- Este exame é realizado somente com solicitação médica.

- Menores de 18 anos devem estar acompanhados de um adulto responsável para a realização do exame.

- O cliente deve entregar no dia da coleta o Questionário preenchido e assinado por ele (obrigatório) e pelo médico solicitante (recomendável, porém não obrigatório).

- Esse Questionário pode ser retirado em qualquer unidade ou solicitado por e-mail para [email protected] (o e-mail será respondido em até 48h)

- Caso não seja possível ter o Questionário preenchido pelo médico solicitante, o Fleury oferece de maneira OPCIONAL a consulta de aconselhamento genético, a fim de preencher o questionário e esclarecer eventuais dúvidas do exame.

- O exame pode ser oferecido a partir de coleta de saliva ou e swab.
"

Processamento e adequação da amostra

"""""""Não manipular
- Se amostra colhida em EDTA, enviar o material refrigerado para setor de Métodos Moleculares acompanhado do Questionário original preenchido;

- Se a amostra colhida for saliva ou swab, enviar o material em temperatura ambiente para setor de Métodos Moleculares acompanhado do Questionário original preenchido;

- Rejeitar amostras de sangue colhidas em tubo com heparina ou qualquer tubo que não esteja de acordo com o solicitado no procedimento de coleta;

Estabilidade da amostra de sangue:
Temperatura ambiente: 72 horas;
Refrigerada (2-8 ºC): 5 dias;
Congelada (-20 ºC): não aceitável.

Estabilidade da amostra de saliva ou swab:
Temperatura ambiente: 30 dias
Refrigerada (2-8ºC): 30 dias
Congelada (-20ºC): não aceitável.
"

Método

Sequenciamento completo (NGS - sequenciamento de nova geração) de todas as regiões codificantes e regiões flanqueadoras adjacentes aos éxons de 230 genes relacionados a epilpesias e ataxias: AARS (AARS1), ACER3, ADAM22, GPR98 (ADGRV1), ADSL, AIMP2, ALDH5A1, ALDH7A1, ALG13, AMT, AP3B2, ARHGEF9, ARV1, ARX, ATP13A2, ATP1A2, ATP1A3, ATP6V1A, ATP7A, ATP8A2, BRAT1, BSCL2, BTD, CACNA1A, CACNA1D, CACNA1E, CACNB4, CAMK2A, CASR, CCDC88A, CDK5, CDKL5, CERS1, CHD2, CHRNA2, CHRNA4, CHRNB2, CLCN2, CLN3, CLN5, CLN6, CLN8, CLTC, CNNM2, CNPY3, CNTN2, CNTNAP2, CPA6, CPLX1, CSTB, CTSD, CYFIP2, DCX, DDC, DEAF1, DENND5A, DEPDC5, DHDDS, DIAPH1, DLAT, DNAJC5, DNM1, DOCK7, EEF1A2, EIF2S3, EMX2, EPM2A, EXT2, FOLR1, FOXG1, FRRS1L, GABBR2, GABRA1, GABRA2, GABRA3, GABRA5, GABRB1, GABRB2, GABRB3, GABRG2, GAMT, GATM, GBA (GBA1), GCSH, GLDC, GNAO1, GOSR2, GPAA1, GRIA4, GRIN1, GRIN2A, GRIN2B, GRIN2D, HACE1, HCN1, HECW2, HEXA, HEXB, HIBCH, HNRNPU, IER3IP1, ITPA, KANSL1, KATNB1, KCNA1, KCNA2, KCNB1, KCNC1, KCNJ10, KCNMA1, KCNQ2, KCNQ3, KCNT1, KCNT2, KCTD17, KCTD7, LAMB1, LGI1, LIAS, LMNB2, LRPPRC, MBD5, MDH2, MECP2, MED17, MEF2C, MFSD8, MMACHC, MOCS1, MOCS2, NACC1, NDE1, NECAP1, NHLRC1, NPC1, NPC2, NPRL2, NPRL3, NRXN1, NTRK2, NUS1, OTUD6B, PACS2, PAFAH1B1, PCDH12, PCDH19, PDHA1, PDHX, PDP1, PIGA, PIGC, PIGN, PIGP, PIGT, PLAA, PLCB1, PROSC (PLPBP), PNKP, PNPO, POLG, POLG2, PPP3CA, PPT1, PRDM8, PRICKLE1, PRRT2, PTPN23, QARS (QARS1), RHOBTB2, ROGDI, RORB, RTN4IP1, RTTN, SARS (SARS1), SCARB2, SCN1A, SCN1B, SCN2A, SCN3A, SCN8A, SGCE, SLC12A5, SLC13A5, SLC25A22, SLC25A42, SLC2A1, SLC45A1, SLC6A1, SLC6A8, SLC6A9, SLC9A6, SMC1A, SMS, SNAP25, SNIP1, SPATA5, SPTAN1, SRPX2, ST3GAL3, ST3GAL5, STRADA, STX1B, STXBP1, SUOX, SYN1, SYNGAP1, SYNJ1, SZT2, TANGO2, TBC1D24, TBCD, TCF4, TMTC3, TPP1, TRIO, TSC1, TSC2, TTPA, TUBA1A, C10orf2 (TWNK), UBA5, UBE3A, UFM1, VARS (VARS1), WASF1, WDR45B, WDR73, WWOX, YWHAG e ZEB2. Este ensaio permite a identificação de variantes de nucleotídeo único (SNVs), pequenas inserções e deleções (INDELS), bem como variações no número de cópias (CNVs) que compreendam três ou mais éxons dos genes estudados e NÃO inclui análise por MLPA. É realizada análise criteriosa em busca de variantes genéticas patogênicas/provavelmente patogênicas. Variantes benignas/provavelmente benignas não serão reportadas.

Interpretação e comentários

"As ataxias hereditárias fazem parte de um grupo de doenças genéticas que cursam com má coordenação lentamente progressiva da marcha, movimentos das mãos e olhos, frequentemente associada à disartria. A origem das ataxias está geralmente associada à atrofia ou disfunção cerebelar, lesões medulares ou neuropatia sensorial periférica. A história familiar positiva de ataxia, ou a presença de mutação patogênica identificada na família confirma seu caráter hereditário. O diagnóstico diferencial das ataxias hereditárias inclui as ataxias adquiridas (não genéticas) como alcoolismo, deficiências de vitaminas, esclerose múltipla, doenças vasculares, tumores metastáticos primários ou doenças paraneoplásicas associadas à carcinoma oculto de ovário, mama ou pulmão. As ataxias hereditárias podem ser subdivididas primeiramente pelo modo de herança (autossômica dominante, recessiva, ligada ao X ou mitocondrial). O gene ou locus cromossômico envolvidos com fenótipo também diferenciam as ataxias. As ataxias de herança autossômica recessiva incluem um grande número de genes e condições clínicas. A metodologia de escolha para investigação molecular das ataxias recessivas, se gene a gene ou lançando mão de um painel multigene, depende da assertividade da hipótese diagnóstica, que é indicada pelo modo de herança, características clínicas extra-ataxia, etnia, idade de início dos sintomas e disponibilidade de tratamento.
As epilepsias formam um grupo de síndromes neurológicas crônicas, decorrentes de alterações das funções cerebrais, associadas ou não a outras condições patogênicas. As síndromes epilépticas são divididas em sintomáticas, criptogênicas e idiopáticas. As síndromes epilépticas iniciadas na infância podem provocar sequelas neurológicas graves, dependendo de sua evolução clínica. Entre elas estão a epilepsia Rolândica, síndrome de Lennox-Gastaut, síndrome de West, síndrome de Rett, síndrome de Angelman e síndrome de Dravet. Fatores genéticos estão sabidamente envolvidos na etiologia de diferentes epilepsias, porém a identificação de genes causais tem ocorrido, em grande maioria, nas epilepsias monogênicas, que perfazem apenas 12% das síndromes epilépticas. Deve-se pensar em causas genéticas de epilepsia para os pacientes que apresentem encefalopatia epiléptica, tal como síndrome de West, síndrome de Otahara e síndrome de Dravet, além de outras formas de epilepsia grave, de início neonatal ou no lactente. Pacientes com epilepsia mioclônica progressiva, tal como as lipofuscinoses ceróides neuronais. Ou mesmo, pacientes com epilepsia e atraso do desenvolvimento, na presença de túberes corticais, angiomiolipomas renais e rabdomioma intracardíaco, manifestações frequentemente encontradas no complexo da esclerose tuberosa (genes TSC1 e TSC2). A definição da etiologia das epilepsias geneticamente determinadas permite a indicação de condutas clínicas para o tratamento ou manejo da condição, como por exemplo: Oferecer um tratamento mais apropriado para pacientes com a síndrome de Dravet por mutação em SCN1A, evitando o uso de medicamentos como lamotrigina e carbamazepina, indicação de carbamazepina para indivíduos com mutação em SCN8A e suplmenetação diária de piridoxina para pacientes com encefalopatia epiléptica associada ao gene ALDH7A1. Utilizar de forma mais racional exames complementares, evitando por exemplo a repetição de exames de imagem ou de estudos neurofisiológicos desnecessários. Planejar melhor o tratamento a longo prazo: pacientes com mutação em KCNQ2 podem ter crises de difícil controle nos primeiros meses de vida, que posteriormente se atenuam significativamente, de forma espontânea. Oferecer aconselhamento genético. É importante lembrar que muitas das encefalopatias epilépticas decorrem de mutações de novo (i.e., não foram herdadas dos genitores), com baixo risco de repetição na família. Por outro lado, epilepsias mioclônicas progressivas são quase todas de herança recessiva, com risco de repetição em futura prole do casal de 25%. Em casos de epilepsia com claro componente ambiental, tal como ocorre nas encefalopatias hipoxicoisquêmicas, a chance da investigação genética trazer algum benefício é reduzida. Ao contrário do que ocorre com a síndrome de Dravet, que tem uma alta probabilidade de ser geneticamente determinada, raramente se encontra alterações genéticas em casos de síndrome de Doose. "

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