Painel molecular para pneumonias

O diagnóstico etiológico de pneumonias graves e a escolha do tratamento antimicrobiano empírico podem ser grandes desafios na assistência ao paciente. No contexto atual da pandemia de Covid-19, essa definição ganha ainda mais relevância.

O painel molecular para pneumonias permite a identificação de agentes bacterianos, típicos e atípicos, de genes de resistência antimicrobiana e também de agentes virais das pneumonias graves, comunitárias ou hospitalares. Entretanto, é importante ressaltar que o novo coronavírus (Sars-CoV-2) não está entre os vírus pesquisados.

O teste é feito por PCR multiplex em tempo real automatizada (FilmArray) em amostras como lavado broncoalveolar, minilavado broncoalveolar, lavado brônquico, aspirado brônquico, aspirado traqueal, secreção traqueal e escarro. A análise leva 70 minutos e está disponível 24 horas por dia, pois não requer mão de obra especializada em métodos moleculares.

Para as 15 bactérias pesquisadas (veja boxe), exceto a Klebsiella aerogenes, a sensibilidade média do teste é de 90,9% a 100% e a especificidade, de 88,9% a 99,5%, segundo o fabricante. Para a K. aerogenes, a sensibilidade e a especificidade alcançam, respectivamente, de 75,0% a 85,7% e de 98,9% a 99,2%. O limite de detecção reprodutível para as bactérias quantificadas pelo teste é da ordem de 10⁵ UFC/mL.

O painel não permite estabelecer uma correlação definitiva entre bactérias e genes detectados, uma vez que espécies bacterianas não identificadas pelo ensaio podem estar presentes, albergando um ou mais dos sete genes de resistência contemplados no exame. Para esses genes, as concordâncias positiva e negativa variam de 92,6% a 100%.

Apenas para os genes mecA ou mecC, associados à resistência aos betalactâmicos, exceto ceftarolina em Staphylococcus, é possível estabelecer a correlação entre sua presença nas espécies do complexo Staphylococcus aureus, visto que a inserção do cassete mec ocorre ao lado da orfX, uma peculiaridade flagrada pelo teste. Nesse caso, as concordâncias positiva e negativa variam de 87,5% a 95,9%.

Na pesquisa de agentes das pneumonias atípicas, o teste detecta, mas não quantifica, três bactérias, com sensibilidade de 87,5% a 100% e especificidade de 100%. Já para os 11 vírus contemplados pelo teste, a sensibilidade vai de 76,5%, para o adenovírus, até 100%, enquanto a especificidade fica entre 98,2% e 99,8%.

Vale lembrar que os resultados do painel devem ser sempre confirmados por cultura quantitativa e antibiograma. Além disso, a ausência de detecção de genes de resistência não configura evidência definitiva de sensibilidade antimicrobiana, tendo em vista que a resistência bacteriana aos antimicrobianos pode ocorrer por outros múltiplos mecanismos.

Quadro
Agentes pesquisados pelo painel molecular para pneumonias:

Bactérias*:
- Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complexo
- Enterobacter cloacae complexo
- Escherichia coli
- Haemophilus influenzae
- Klebsiella aerogenes
- Klebsiella oxytoca
- Klebsiella pneumoniae grupo
- Moraxella catarrhalis
- Proteus spp.
- Pseudomonas aeruginosa
- Serratia marcescens
- Staphylococcus aureus
- Streptococcus agalactiae
- Streptococcus pneumoniae
- Streptococcus pyogenes
*Quando em quantificação aproximada mínima de 10E4 UFC/mL

Agentes de pneumonias atípicas:
- Chlamydia pneumoniae
- Legionella pneumophila
- Mycoplasma pneumoniae

Vírus:
- Adenovírus
- Coronavírus 229E, OC43, HKU1 e NL63 (exceto Sars-CoV-2)
- Metapneumovírus
- Rinovírus/enterovírus
- Influenza A
- Influenza B
- Parainfluenza
- Vírus sincicial respiratório

Genes de resistência:
- bla_CTX-M (resistência às cefalosporinas)
- bla_IMP (resistência a carbapenêmicos, cefalosporinas e piperacilina)
- bla_KPC (resistência a carbapenêmicos, cefalosporinas e piperacilina)
- bla_NDM (resistência a carbapenêmicos, cefalosporinas, piperacilina e ceftazidima-avibactam)
- bla_OXA-48-like (resistência ao ertapenem e à piperacilina)
- bla_VIM (resistência a carbapenêmicos, cefalosporinas e piperacilina)
- mecA ou mecC (resistência a betalactâmicos)

Consultoria médica

Dr. Jorge Luiz Mello Sampaio
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Dr. Paola Cappellano Daher
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